故事讲述了一个叫做小纽扣吉姆的男孩寻找身世之谜的奇幻旅程。在成功救回李丝公主后，小纽扣和朋友火车头司机卢卡斯，还有它们的两辆”百变“火车头埃玛和摩力又开始了新的旅行——一路上，他们遇到了很多困难，比如要为小岛安装一个“远处看很高大，近处看却很小”的灯塔，寻找只有火生物和水生物一起合作才能制造出来“永恒的水晶“，战胜力大无穷却连十二和十三都分不清楚的海盗，并把他们改造为”十二个不可战胜的人“……
两辆火车头埃玛和摩力，在陆地上行驶，他们是火车；塞上柏油麻絮就可以在海上航行，是条船；装上磁铁结构，就可以随心翱翔，是架飞机；他们还可以沉入海底，是个潜艇……
这次，两个火车头司机吉姆和卢卡斯，他们又要出发了——为了寻找小纽扣吉姆的身世之谜。一路上，他们遇到了很多困难，比如要为小岛安装一个“远处看很高大，近处看却很小”的灯塔，寻找只有火生物和水生物一起合作才能制造出来“永恒的水晶“，战胜力大无穷却连十二和十三都分不清楚的海盗，并把他们改造为”十二个不可战胜的人“……
小纽扣和他的朋友以他们的勇气和智慧，用他们的善意和宽容，将这些看似矛盾的事物，化为和谐，最终小纽扣不但解开了自己的出身之谜，还找到了自己的国家。
