《金匮要略病证与方剂研究》的主要内容分为病证篇和方剂篇二部分。病证篇选《金匮》篇名中出现的40个病名为主，以【经典概论】、【发展源流】和【临床探讨】三个栏目展开。【经典概论】以原文所述为依据，简要勾勒每一病证证治的主要内容；【发展源流】以古代文献为主，首先叙述病名沿革，然后阐述后世该病证在主症、病因病机、治法方药等方面的变化和补充；【临床探讨】以现代文献为主，主要围绕今人对该病证的具体认识展开，如目前临床的证治经验、与现代医学相关内容的联系等等。方剂篇选《金匮》常用的90首方剂为主（《伤寒论》中的有些方剂省略），以【经典概述】、【临床应用】和【现代研究】三个栏目展开。【经典概述】讲清楚该方在《金匮》中的应用，包括药物配伍、方证辨析以及该方在后世的加减变化等；【临床应用】归纳该方在目前临床上的具体运用情况，如适应范围；【现代研究】主要归纳药理研究等方面的新进展。
